南开大学自2008级硕士研究生起，以经济学院为试点，试行了一种新的研究生培养方式：即在同一专业内实行“学术应用型硕士生”与“学术研究型硕士生”分类并行培养。“学术应用型硕士生”第二学年将在第一学年理论课程学习的基础上，适当强化应用性课程的学习，通过论文写作，达到适应社会对应用型高级专业人才的要求后就业；“学术研究型硕士生”则在第二学年以硕士生身份与当年录取的博士新生同期学习，该学年结束后如达到要求则正式进入博士学习阶段。南开大学副校长、研究生院院长佟家栋认为，我国早期的硕士教育以培养“学术精英”为目标，培养年限为3年或两年半。而随着我国社会经济发展，对应用型人才的需求加大，大量硕士生毕业后走上应用型工作岗位，因此出现了旨在适应这种形势的两年制培养模式。然而，大部分改革高校学制缩短了，培养方式却没有改变，仍然是理论课程偏多，应用课程偏少，造成社会需求与人才培养在结构上的不对称，许多两年制硕士生在就业市场上缺乏竞争力。分类培养，让学生能灵活选择适合自己的教育形式，是在两年学制下保证教学质量的重要途径。南开试行的研究生分类培养是在同一学科专业下，按照两类不同的方案进行培养，“学术应用型硕士生”致力于走上应用型工作岗位；“学术研究型硕士生”致力于进行深层次理论知识学习和科学研究。两套课程培养两种类型的人才，既符合学生兴趣，又适应了社会需要。这既是对以两年制为基础的弹性学制的延续，也是对研究生培养的优化。
