作为中国乃至亚洲地区最大的研究生培养基地，研究生院现有114个博士学位授权点，130个硕士学位授权点，其中一级学科博士学位授权点26个。从新中国建立学位制度的1981年到2005年，统一授予硕士和博士学位共42999名，其中博士学位15985名，硕士学位27014人。在保持数量优势的同时，研究生院一直保持着较高的培养质量。1999年到2005年，在全国百篇优秀博士论文的评选中，中国科学院研究生院共有107篇论文入选，占全国总数(688篇)的15.6%。在中科院知识创新工程重大项目中，研究生特别是博士生已经成为创新队伍的重要生力军。
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