2006年，中国科协积极支持全国学会开展在华国际学术交流，举办了很多有国际影响的国际学术大会，对于促进学会自身改革和发展、提高中国科学家在国际学术团体的地位起到了积极的促进作用。如：
3月31日至4月4日，由中国机械工程学会和美国机械工程师学会联合主办的“2006国际机械工程教育大会”在京举行。来自中国和北美、欧洲、亚洲的27位一流教授、专家、学者和企业家围绕2020年工程师全球展望、研究生教育和科研的创新与国际合作、本科生教育及其国际合作、机械工程教育的全球资格认证、全球性的产学研合作五大关注焦点做了精彩的主题报告。另有17位各国高校机械工程学院院长和系主任在会议期间举行的国际论坛上发表了演讲。
6月17至21日，被誉为国际古生物学界“奥林匹克盛会”的“第二届国际古生物学大会”在北京大学成功举行。国际古生物学大会是国际古生物学界的最高组织机构“国际古生物学协会”的系列学术年会，每四年举行一次，是世界古生物学科最高级别的大会。此次大会以“远古生命和现代研究途径”为主题，对近年来古生物学的新发现和新进展进行深入而广泛的研讨。来自中国、美国、俄罗斯、日本、英国、德国、法国、瑞典、等近40个国家的800余位古生物学工作者和来宾出席了本次盛会。
6月28日到7月1日，第五届国际病理生理大会在北京召开，这是首次在中国召开的国际病理生理学大会。来自中国、美国、英国、德国、法国、俄国、等43个国家和地区的948位专家共同交流病理生理学科的最新研究成果。在此次大会上，韩启德院士成功当选为国际病理生理学会主席，张幼怡教授当选国际病理生理学会秘书长，王建枝教授当选国际病理生理学会理事。
7月2日-7日，第15届世界药理学大会在北京召开。世界药理学大会是世界最大规模和最高水平的药学相关科学研究人员的学术交流会议，每四年举办一次，提前八年申办。本次大会是迄今为止在中国举办的规模最大、学术水平最高的一次药理学大会。来自中国、美国、德国、英国、法国、日本、加拿大、澳大利亚、巴西、瑞典、丹麦的23位国际顶级科学家作了精彩的大会发言，其中两位是诺贝尔化学奖获得者。内容涉及药理学、生理学、生物化学、免疫学、细胞生物学、生物物理学、解剖学等方面的55个专题会，5个研讨会，发言人数超过300人，共有100多个国家和地区的3100多人参加了本次大会，外宾人数约占三分之二。中国药理学会林志彬教授成功当选国际药理学联合会(IUPHAR)国际组织执委。
(来源：中国科学技术学会)
