2012年1月22日，除夕夜，北京大学终身讲席教授、生命科学院院长饶毅在科学网博客上发表博文：校长挨骂和教授骂人：谁是北京大学的耻辱？谈到北京大学教授孔庆东用动物问候香港人，他写道：“北大是兼容并包，学校对这样的教授没办法。”博文发表后立即在海内外引起强烈反响，他收到了自己的朋友、美国耶鲁大学分子、细胞与发育生物系副教授钟伟民的电子邮件：
“你误会了兼容并包的内涵。兼容并包是指学术自由，骂人，特别在公共场合骂人，不是言论自由的一部分，不会被美国大学容忍。如果我像孔庆东那样公开骂人，肯定会被大学批评处理，虽然不会失去终身教职。”
就学术自由与言论自由、大学和大学教授在参与公共事务上的基本品质要求，钟伟民在接受采访时说，大学追求、崇尚理性探讨，大学里的言论自由是理性言论的自由，是指每个人能够理性地表达自己不同的观点和想法，但不是什么话都可以说，骂人、凭空揑造是非理性的言论，这在美国的大学里是绝对不允许的，如果出现这类事件，大学也肯定不会说这是我们教授的言论自由，我们支持这样的教授，而且会处分当事教授。
他强调：“北京大学兼容并包的精神应该是指学术自由、观点上的自由。大学教授在公共场合发言应该有两个基本原则：第一，有理有据，不能凭空揑造；第二，不管什么人，不能去骂人，哪怕是有人做错了事，也应该就事论事地分析。如果在大学或其它公共场合骂人，很难想象美国的任何一所大学会将这样的教授作为好教授。”“理性发言首先需要理性分析、就事论事地评价，不能有歧视和偏见。比如在这次内地儿童在香港地铁进食事件中，可以就事评论；一方面它反映出从内地到香港旅游的人可能不太懂香港法规或者个别人不遵守法规，另一方面也可以评价这位香港人的处事方法和态度，即由此说大陆人怎么不好，这样讲是不对的，但因此骂香港人是狗，是绝对不允许的，这在逻辑上也是站不住脚的。”
香港行政长官参选人唐英年在评价孔庆东的言论表示，一名教授应该有教授的品格。钟伟民认为，一所大学应该确定言论自由的规范，对教授的要求应该不同于一般老百姓。“作为一位学者，在讨论时要尊重对方，互相尊重是理性讨论的前提，绝对不允许骂人。作为中国最好的大学之一，北京大学应该对自己的教授有最起码的要求，教授必须很理性地讨论一件事，否则对大学和社会都没有好处。”“在这件事上，孔庆东滥用了言论自由。我不知道他是否理解学术和言论自由的内涵，或者是理解错了，或者是知道但仍然我行我素。”他说，“令我惊讶的是，上次孔庆东辱骂记者后，报道称北大校长说支持这样的教授，在国外这是不可思议的事。”
钟伟民和饶毅是多年的朋友，双方有不同的观点都会告诉对方。尽管坦率指出饶毅对大学言论自由的理解有些糊涂，但钟伟民仍然非常欣赏饶毅，“讲老实话，中国不缺骂人的人，中国缺乏的是敢说真话的人。饶毅是敢说真话的人，而且他讲话也很有理性，他在写文章谈论一件事情时，会先将事情的来龙去脉和前因后果搞清楚。”
钟伟民认为，大学应该是社会的一座灯塔，发出知识和智慧的光芒，西方大学追求理性的探讨，设立终身教职的原因就是保证言论自由，即尽管你的看法不被大学或政府认可，但你持这种看法的自由是受到保护的。谈到对国内学者的建议，他希望大家讨论时要更加理性，“国内的很多讨论感性成分更多一些。在针对公共事件发表言论之前，教授应该做的事是将事情搞清楚。希望中国大学成为理性探讨的一个楷模或榜样。”
