为加强科学院与高校间的资源结合，带动和促进高校和研究所在教育和科研工作方面的相互配合、支持和共赢，促进创新人才培养与教育工作的发展，提高人才培养质量，探索开展联合培养研究生的方法和途径。2011年4月，昆明动物研究所与安徽大学经过磋商共同签署了《联合培养协议书》，并于当年开始了联合培养研究生的招生。
2011年昆明动物研究所在安徽大学招收了7名联培硕士生。他们在安徽大学完成为期一年的学位课程学习后，进入研究所开展为期两年的学位论文工作。经过两年的学习，6名研究生（其中一名因故返回安大学习）顺利完成了其学位论文的工作。经合作双方商定，今年5月24日在昆明动物研究所举行了6名研究生的毕业论文答辩会。安徽大学健康科学研究院张部昌院长、生命科学学院张保卫教授、校学位办王春知老师和施春霖老师代表安徽大学参加了答辩会。答辩委员会成员由张部昌教授、张保卫教授、姚永刚研究员、黄京飞研究员和郑永唐研究员组成，姚永刚担任答辩委员会主席主持了整个答辩会。答辩会上，6名同学依次对自己的论文工作进行了汇报，并回答了评委们的提问。经答辩评委会评议和无记名投票表决，6名硕士生顺利通过了毕业答辩。
答辩会上，张部昌和姚永刚分别对6名硕士生提出了宝贵的意见，并就联培生的培养交换了意见，希望双方老师能够更加重视对联培生的指导与管理，培养出更优秀的学生，并期望通过科教联合，扩大双方在教育、科研、学术活动等多个层面的合作，从而实现共赢。
